I en dystopisk by på randen av kollaps etter at kakerlakkene har tatt over, sender et brorskap 17 år gamle Tim på et oppdrag for å sprenge kakerlakkenes reir for å redde hjembyen hans. Men et møte med en fremmed får Tim til å revurdere sin virkelighetsoppfatning.
Kakerlakkene er en animert fabel om ekskludering og ekstremisme, som viser hvordan søken etter aksept kan få fatale konsekvenser. I en tid hvor ytre høyre igjen marsjerer over mange europeiske land, har filmen som mål å sende en advarsel.